Tháng 8/2020, chủ đầu tư tiến hành khởi công, triển khai xây dựng hạ tầng khi chưa được giao đất thực địa. Ngày 24/11/2020, UBND tỉnh Nghệ An đã ra công văn 8303/ UBND- NC yêu cầu Công ty Cổ phần Đầu tư và Thương mại Dầu khí Nghệ An giữ nguyên hiện trạng, chưa được thi công các hạng mục công trình của dự án do chưa hoàn thành thủ tục đất đai. Giao Sở Tài nguyên và Môi trường chủ trì, tổ chức kiểm tra, lập hồ sơ xử lý các hành vi, vi phạm hành chính xẩy ra (nếu có). Giao UBND TP Vinh chỉ đạo các phòng ban liên quan và UBND xã Hưng Lộc theo dõi giám sát.
Đã gần 02 tháng từ khi có chỉ đạo của UBND tỉnh, nhưng Sở Tài nguyên và Môi trường Nghệ An vẫn chưa xử lý, thậm chí doanh nghiệp vẫn ngày đêm triển khai thi công. Trong khi, dự án bám mặt đường chính, gần UBND xã Hưng Lộc, khiến người dân hoài nghi, chính quyền xã Hưng Lộc đang "mắt nhắm, mắt mở" cho doanh nghiệp "làm trái" chỉ đạo của UBND tỉnh Nghệ An.
Ngoài ra, liên quan đến Dự án này bà Trần Thị Toàn, trú tại Khách sạn Toàn Thắng Stone, đường V. I. Lê - Nin có đơn thư tố cáo gửi cơ quan chức năng với nội dung: Bà Toàn đã chuyển cho bà Nga Phú Nguyên số tiền hơn 71 tỷ đồng mua lại Công ty Cổ phần Đầu tư và Thương mại Dầu khí Nghệ An... và chi trả đền bù giải phóng mặt bằng Dự án Hưng Lộc.
Ngày 29/1/2021, Công an tỉnh Nghệ An có Công văn số 444/CAT - PV01 gửi Sở Tài nguyên và Môi trường với nội dung: Đây là vụ việc đang được Cơ quan Điều tra tiến hành điều tra, xác minh, chưa xác định có hay không dấu hiệu tội phạm; đồng thời vụ việc đang có tranh chấp, xung đột quyền lợi giữa các bên liên quan. Do đó, để đảm bảo quyền, lợi ích hợp pháp của công dân và doanh nghiệp, Công an Tỉnh Nghệ An kính trao đổi thêm thông tin để Sở Tài nguyên và Môi trường nghiên cứu, báo cáo, tham mưu UBND tỉnh giải quyết các vấn đề có liên quan đến công tác quản lý Nhà nước, nhất là vấn đề đang có khó khăn, vướng mắc theo chức năng thẩm quyền và quy định pháp luật.
Tiếp theo, ngày 17/2/2021, UBND tỉnh Nghệ An tiếp tục có Công văn số 810/UBND - NC chỉ đạo Sở Tài nguyên và Môi trường xử lý đơn thư của bà Trần Thị Toàn theo quy định và pháp luật. Kết quả báo cáo UBND tỉnh trước ngày 5/3/2021.
Nhằm tuân thủ những định pháp luật và ảnh hưởng xấu đến việc kêu gọi xúc tiến đầu tư của tỉnh Nghệ An, thiết nghĩ, chính quyền địa phương tỉnh Nghệ An cần gấp rút chỉ đạo xử lý "những lộn xộn" tại Dự án Khu nhà ở cho người thu nhập thấp và cán bộ công nhân viên tại xã Hưng Lộc, do Công ty CP thương mại và đầu tư Dầu Khí làm chủ đầu tư.
